夏秋季節氣溫較高，龜群活動頻繁，採食及排糞較多，因而龜池水體容易汙濁和易滋生有害細菌，從而使水體發臭，有的還會因糞便及剩料的腐敗發酵而使池水氨氮超標，進而誘發各種疾病。因此，保持養殖水體清潔，抑制致病菌滋生就是此階段的主要任務。

水對於構建龜的生存環境非常重要，所以我們一定不能掉以輕心。龜池的水最好能夠流動起來，成為活水。所謂戶樞不朽，流水不腐。水流動起來，可以在一段時間內保持水質，防止滋生細菌。可以搭建一些景緻，在其中放置過濾裝置。同時在水中放置一些水植，透過陽光照射，產生光合作用，增加水中含氧量。也有利於淨化水質。水要定時更換，但不要過於頻繁。

養龜久了，龜池有可能會出現相應的顏色，這其實是因為池水中含有大量的浮游微生物。各類浮游微生物細胞內含有不同的色素，這些色素是可以進行光合作用，把太陽光的能量轉化為自身所需的能量。

（1）不好的水體

灰色的水體是微生物死後沒有及時清理的結果，會有腥臭味，很難聞，這種水體是最壞的水質，同樣請立即換水，並做好消毒工作。

紅色的水體不適宜養殖龜，應立即更換水體。這種主要是含有大量的裸藻、血紅裸藻會產生毒素。

藍綠色的水體應立即更換水體。水裡含有了大量的微囊藻，會產生毒素，汙染水體。

（2）好的水體

油綠色或黃綠色是池水裡含的綠藻和隱藻比較多。綠藻或是隱藻對龜無害，同樣是屬於龜能消化的浮游微生物，所以見到這種水質大可放心，這種水體是比較好的。

淡黃色主要是以矽藻、隱藻為主，相對來說是比較好的，池水裡含氧量也比較多。

茶褐色其中的矽藻、金藻、隱藻和黃藻比較多。含有這些藻類的龜池水溶氧也十分充足，對養龜有一定的好處。