一般說來，性功能障礙可從病因、發生時間及性行為的過程來進行分類。按病因可分器質性和精神性兩種；按發生時間可分為原發性和繼發性兩種。如果按性行為的過程分類，可分為：①性慾障礙：包括性慾減退、性厭惡和性慾亢進，其原因可能是器質性異常或精神性異常。②勃起障礙：包括陽痿和陰莖異常勃起。陽痿是指男性不能達到或保持足以完成性交的勃起，病因可以是器質性的，也可以是精神性的；陰莖異常勃起是指陰莖持續勃起，以致疼痛，多為器質性。③性交障礙：多見於女性，絕大部分是因恐懼而引起。④射精障礙：包括早洩、不射精、逆行射精、遺精等。⑤性感覺障礙：包括痛性勃起、痛性射精、外生殖器的感覺異常和情慾誘發的感覺減退等。

性功能障礙的診斷方法有多種，目的都是為了最終作出正確和細緻的治療選擇。①敘事性診斷：按主訴症狀進行的分類，診斷和治療則以此為基礎。②心理學診斷：著重於對機體疾患的病理生理情況和功能性疾患的病理動力學方面的瞭解。③醫學診斷。 性功能障礙由於不能順利進行性生活，必然會影響生育功能，而且，由於得不到性滿足，還會影響夫妻間的感情。丈夫由於缺乏“陽剛之氣”而萎靡不振，妻子由於“望而不達”則對性生活產生厭惡，這樣更會促使夫妻雙方對性慾產生抑制。性功能障礙的病因包括功能性障礙和器質性障礙兩方面，功能性障礙佔大多數，通常是由手淫、性交過度、性交中斷等不正常性生活習慣和緊張、過度興奮、驚恐、缺乏信心以及極度疲勞等不正常精神狀態所引起；器質性障礙較為少見，其原因主要有脊髓損傷、慢性尿道炎、前列腺和附睪炎等，也可因會陰或陰囊部手術以及全身性疾病所引起。

有關性功能障礙的不同解釋甚多：①持生物學觀點者認為，性功能障礙多為軀體疾病的影響以及年齡的影響和自主神經功能紊亂所引起。②持心理動力學觀點者認為，性功能障礙是由於患者幼年時期的心理壓抑，成年後對異性的敵意、忿恨和厭惡，促使這些人對性生活產生負性情感所引起。③持行為理論觀點者認為，性功能障礙是學習得來的一種異常行為，由於傳統觀念的影響，性教育的片面、膚淺、錯誤以及初期性體驗障礙，往往影響到婚後性行為，導致性功能障礙的發生。④持人本主義理論觀點者認為，早期違背意願的性行為、傳統的性貞操觀念、被歪曲的初期性體驗等，使患者加強了對性的戒備感，形成了一種性壓抑心理狀態而發病。⑤持生物-心理-社會模式理論者認為，性功能障礙是由個體發育中的性壓抑（如幼年時代的傳統性觀念的影響、家庭關係中的心理衝突、性角色培養的異常、兒童期性經歷中的創傷、性身份的錯誤、初次性交的創傷等），對性的錯誤認識，夫婦情感不和諧，人際關係不協調以及長期工作緊張疲勞、大量吸菸酗酒、醫源性影響等因素，長時間地共同作用於心理，從而形成了錯誤的心理狀態。

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