九陰真經是貫穿射鵰英雄傳和神鵰俠侶兩部作品，在最後一次華山論劍時，透過少年張三丰（張君寶）和覺遠大師，引出了另一種絕學，可與九陰真經相媲美的九陽真經。
九陰真經引發了武林中各方勢力的爭奪，由王重陽發起的華山論劍，目的之一就是確定九陰真經的歸屬，並藉此形成了以王重陽為首，東邪、西毒、南帝、北丐並存的華山五絕。當王重陽死後，九陰真經重現江湖，黃藥師喪妻、西毒發瘋、南帝出家、北丐重傷、周伯通困囚桃花島，都和九陰真經有關。
郭靖作為江湖新勢力的代表人物，在周伯通的指點下，死記硬背的記下了上下兩冊九陰真經，更有幸獲得了梵文總綱的中文翻譯版，是唯一學到完整版九陰真經的高手，二次華山論劍時，郭靖就能力拼東邪、北丐三百招不落下風，在黃蓉的幫助下，鎮守襄陽，提出了“為國為民，俠之大者”的口號，成為了人人敬仰的“北俠”。
有幸學到九陰真經的，無一不是絕頂高手，除了郭靖以外，西毒有逆練版，南帝懂得總綱，北丐會療傷篇和易筋鍛骨篇，周伯通只有梵文部分不會，所學相對完整，古墓派的小龍女和楊過也領悟了部分九陰真經，自襄陽城破後，郭靖黃蓉夫婦戰死，九陰真經就成了武林中失傳的絕學！
後五絕時代的領軍人物是武當派的開山祖師——張三丰，他幼年時曾得到過覺遠禪師的指點，學到了部分九陽真經，瀟湘子、尹克西盜走的四卷楞伽經中，就暗藏著九陽真經，覺遠受罰、何足道挑戰少林、張三丰被驅逐、都是因九陽真經引起的連鎖事件。
江湖上只有一個張無忌學到了完整的九陽真經，他在幼年時受玄冥神掌的折磨，只有學會完整的九陰真經才能去除體內寒毒，在給白猿做外科手術時，在“患者”肚子裡發現了當年瀟湘子、尹克西偷走的少林楞伽經，張無忌的逆襲之路也由此開始。
武林至尊，寶刀屠龍，號令天下，莫敢不從，倚天不出，誰與爭鋒！這段傳播度最廣的武林格言，導致了倚天屠龍時代的爭奪目標變成了屠龍寶刀，誰都想參透屠龍刀中的奧秘，成為號令天下的武林至尊，可其中的秘密只有峨眉派的掌門才知道！
當初襄陽城破，黃蓉融掉了楊過送給他們的玄鐵重劍，加入西方精鐵，鑄造出一刀一劍，刀號屠龍，劍名倚天，屠龍刀和倚天劍互砍，就能得到九陰真經和武穆遺書，倚天屠龍只得其一，不過是得到了削鐵如泥的利器而已，峨眉派世代相傳的秘密成就了周芷若。
少林寺的屠獅大會上，周芷若施展九陰白骨爪，連續挫敗多位高手，完勝殷梨亭，打平俞蓮舟，險勝張無忌一招，受張無忌的邀請，九陰九陽合力攻破金剛伏魔圈，當張無忌受制於少林三渡的危急時刻，周芷若突然出手控制住謝遜，以此威脅張無忌！
周芷若短短時間內武功突飛猛進，完全是因為修煉了九陰真經，雖然內功火候不足，但憑藉詭異的招式，還是打了別人個措手不及，風頭出夠了，卻不知道九陰真經其實還有傳人！而正是九陰真經的正宗傳人，讓周芷若徹底現了“原形”。
倚天屠龍記中最神秘、最驚豔、最有氣場的黃衫女子就這麼輕輕地來了，揮一揮衣袖，帶來的是真正的、失傳已久的九陰白骨爪！她的武功似乎與周芷若乃是一路，飄忽靈動，變幻無方，但舉手抬足之間卻是正而不邪，如說周芷若形似鬼魅，那黃衫女子便是態擬神仙。
周芷若一手持長鞭（射鵰英雄傳裡的梅超風用的也是四丈長的毒龍銀鞭），一手持刀，恨不能在黃衫女身上驗證自己的九陰真經，可對方雲淡風輕般的從容應對，讓吃瓜群眾看得目瞪口呆，黃衫女出手之中頗有引逗之意，似要看明周芷若武學的底細，要是當真求勝，早已將周芷若打倒了！明顯不是一個等級，如果周芷若是本科生，那黃衫女就是博士導師！
從黃衫女出場到離開的有限時間裡，她展示了正宗的九陰真經，還留下了“終南山下，活死人墓，神鵰俠侶，絕跡江湖”的幾句話，從這些線索中不難發現，她是神鵰俠侶的後人，楊過、小龍女正是她的祖先！而她風姿綽約，容貌極美，態擬神仙還頗有幾分小龍女的影子。
黃衫女的年紀約有二十六七歲，楊過隱居時大概有三十六七歲，少林舉辦的屠獅大會是在元朝末年，從南宋末年到元末明初，中間相隔百十年，從時間跨度上看，她應該是神鵰俠侶的第四代傳人！周芷若的九陰真經來自於倚天劍和屠龍刀，是黃蓉流傳下來的，那黃衫女的九陰真經是從何而來？
如果是楊過、小龍女傳給後人的，那就是殘本，他們所學的，是王重陽刻在棺材裡的一小部分，還告訴世人：玉女心經，欲勝全真。重陽一生，不弱於人。這只是在好勝心的驅使下，為了證明他王重陽有招式能破解玉女心經才留下的一部分，其中並不包括九陰白骨爪！
楊過所學很雜，自創的黯然銷魂掌中就借鑑了自己掌握的部分九陰真經，而他與人交手，也從來沒用過九陰白骨爪，黃衫女所學的九陰真經肯定另有出處！連周芷若都承認，她的武功顯然也是以《九陰真經》為基，但醇真深厚，非我所及，我的九陰白骨爪碰上了她便縛手縛腳，竟全無施展的餘地？
既然楊過不可能傳給後代完整的九陰真經，那能傳給古墓派九陰真經的只有兩個，就是鎮守襄陽的郭靖、黃蓉夫婦！襄陽城破前，黃蓉融化了玄鐵重劍，證明楊過和郭氏一門還有往來，鑄造倚天屠龍的目的之一也是不想讓九陰真經失傳，睿智的黃蓉除了透過倚天屠龍傳承武學以外，還有一個更穩妥的辦法，就是把全部的九陰真經傳授給楊過！
楊過贈劍，黃蓉的回報就是九陰真經！黃衫女子自己也說，祖上和丐幫淵源很深，楊過蒙北丐點撥，學會了打狗棒法，黃蓉也照顧過他一段時間，在郭襄16歲生日宴會上，他送的禮物之一就是奪回打狗棒，幫助耶律齊上位，綜上可以看出，古墓流傳下來的九陰真經，就是黃蓉為了回報楊過贈送玄鐵重劍，鑄造屠龍刀、倚天劍傳授給古墓派的！