急性腎炎為自限性疾病，大多預後良好，常可在數月內臨床自愈

；也有少數急性腎炎患者遷延不愈而轉變為慢性腎炎；極個別的急性腎炎患者因病情嚴重及治療失當等原因出現急性腎衰竭或併發其他嚴重病症而死亡。

絕大多數急性腎炎患者於2~4周出現利尿、消腫、降壓，尿檢驗也常隨之好轉

，

血清C3在8周內恢復正常，

病理檢查亦大部分恢復正常或僅遺留系膜細胞增生，但少量鏡下血尿及微量尿蛋白有時可遷延半年至一年才消失，僅有<1%的患者可因急性腎衰竭救治不當而死亡，且多為高齡患者。

注：血清C3也叫血清補體C3，約70%—80%的急性腎小球腎炎、狼瘡性腎炎患者血清C3含量減少，病情緩解後可恢復正常，所以C3這個物質的測定不僅有助於診斷，還可以觀察療效和監測預後。C3降低還可見於自身免疫性疾病、新生兒呼吸窘迫綜合徵、菌血症、組織損害和慢性肝炎。

急性腎炎的多數病例遠期預後良好，可完全治癒。

6%~18%的病例遺留尿異常和（或）高血壓而轉為“慢性”，或於“臨床治癒”多年後又出現腎小球腎炎表現。

一般認為老年患者，有持續性高血壓、大量蛋白尿或腎功能損害者，預後可能較差；散發者較流行者預後可能差；腎組織增生病變重，伴有較多新月體形成者預後差。