作為蔣介石最親密的兩個親人，蔣經國與宋美齡的關係卻並不怎麼好，畢竟對待一個比自己大不了多少的繼母，蔣經國對於宋美齡的芥蒂也實屬正常。要知道蔣經國對於生母的感情是非常好的，因此在得到蔣介石另尋新歡後，他還寫信大罵父親，而宋美齡也因此對蔣經國心生不滿。

不過為了緩解妻子與兒子的矛盾，蔣介石也可謂沒少下功夫，他曾多次冒用宋美齡的身份給蔣經國拍電報慰問，以期望兩人的關係得到緩解。不過不得不說這一招也的確奏效，或許蔣經國真的受到了感動，所以在回國後並沒有與宋美齡爆發直接衝突，基本上在她面前都保持了畢恭畢敬，這也讓蔣介石很是滿意。

然而儘管如此，其實蔣經國與宋美齡的關係一直都十分微妙，兩人彼此都心有芥蒂，所以根本不能相處的坦然。雖然蔣介石作出過很多努力，但都不能從根本上解決兩人的矛盾，最終他也只好放棄。而在老蔣去世以後，蔣經國更是與宋美齡進行了直接的權力之爭，最終由蔣經國佔據了上風，而宋美齡在一氣之下離開了臺灣到了美國定居。

在宋美齡去了美國以後，蔣經國對她一直都不聞不問，兩人也根本沒有任何聯絡。然而在蔣經國病重以後，他卻不知因為什麼緣故突然想起了宋美齡，還幾次給她拍了電報，希望她從美國回來。或許是出於同情的緣故，宋美齡最終還是拋下偏見回到了臺灣，同時也受到了蔣經國熱情的接待。而在之後的相處中，兩人都非常愉快，他們的矛盾也似乎徹底被解決了。

後來蔣經國突然病重去世以後，宋美齡還難過了很長一段時間，而且她還曾說過一番話，讓人聽後心酸不已！宋美齡曾經說道：真是人生無常，經國連個招呼都不打，就這麼爽快的走了。而身邊人在聽到宋美齡的這番感嘆後，都不禁感到心酸。而在蔣經國去世不久後，宋美齡就重新回到了美國，此後一直都沒有再回到臺灣。後來在美國去世以後，她也囑咐朋友將自己的墓穴安在了美國，雖然沒有顯赫的墓碑，卻終究有了一個歸屬。